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微卫星SSR-STR
实验介绍 微卫星位点通常通过PCR扩增和电泳检测,并根据片段大小分离等位基因进行分析;扩增后的等位微卫星可以用多种方法检测,1)传统方法采用聚丙烯酰胺凝胶电泳银染的方法适用于前期批量引物筛选;2)利用ABI遗传分析仪对荧光标记的DNA片段进行检测,结合分子量内标进行DNA片段长度计算,使STR分型变得高效快捷,适合大量样本的检测 SSR 1、实验路线: DNA提取--引物设计合成或者开发---扩增产物---上机跑胶检测----结果分析 2、样本要求 1) 至少15μL样品,浓度为50-100ng/μL; 2) 2%琼脂糖电泳检测有DNA主带,没有降解; 3) DNA经过DNA纯化试剂盒或磁珠纯化; 4) DNA需溶解在TE或灭菌的去离子水里; 5) DNA溶解后,肉眼看不到杂色; 6) 植物材料: 新鲜组织,叶片采用硅胶干燥后或干冰运输; 7) 动物材料: 新鲜组织,无水乙醇封存低温运输;
3、试验结果: 1)各种检测图 2)标准分析: 根据毛细管电泳图谱,将检测峰判读为对应的等位基因; 3)高级分析:聚类分析;多样性分析;多态位点数(AP)、多态位点百分率( P)、平均等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、Nei′s基因多样性指数(H)、Shannon′s信息指数(I)、遗传分化度(Gst)等。
4、试验周期: 10-20个工作日左右(视样本数量及工作量浮动)。
5、客户须知: 3) 本公司对北京客户采取上门取样,异地客户需填写邮寄单
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案例展示:
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