DGGE(一代)
实验介绍 DGGE(denaturing gradient gel electrophoresis),即变性梯度凝胶电泳,是根据DNA在不同浓度的变性剂中解链行为的不同而导致电泳迁移率发生变化,从而将片段大小相同而碱基组成不同的DNA片段分开。具体而言,就是将特定的双链DNA片段在含有从低到高的线性变性剂梯度的聚丙烯酰胺凝胶中电泳,随着电泳的进行,DNA片段向高浓度变性剂方向迁移,当它到达其变性要求的最低浓度变性剂处,双链DNA形成部分解链状态,这就导致其迁移速率变慢,由于这种变性具有序列特异性,因此DGGE能将同样大小的DNA片段很理想地分开,它是一种很有用分子标记方法。现已广泛应用于生物多样性调查、亲缘关系鉴定、基因突变检测等多个领域。
变性梯度凝胶电泳进行微生物多样性分析 1、实验路线: 基因组提取,引物设计,扩增,基因组DNA电泳图, PCR电泳图, DGGE电泳图,聚类分析图,主成份分析图和多样性分析;DGGE胶图主要条带标注,DGGE胶中特异条带的回收,特异条带PCR扩增,特异条带克隆测序,序列比对分析,种属系统发育分析,确定细菌种属关系,获得特定样品中的细菌多样性信息 对海洋,温泉,土壤、环境污泥、水样、动物肠道内容物、酒曲、窖泥等环境中的微生物菌系进行半定量和多样性分析 2、样本要求:
1) 环境样本或环境DNA 样本。 3)请您提供新鲜的且足量的材料,或直接提供纯化好的总RNA或DNA(大于5ug/样品)。 4)提供已知的全长基因序列, GeneBank ID,详细背景资料,DNA/RNA来源、丰度等。 3、试验结果: 我们提供给您DNA 电泳检测图,PCR产物的变性梯度凝胶电泳分析图,需测序样本的测序峰图,序列比对结果及完整的结果分析报告。 4、试验周期: 30个工作日左右(视样本数量及工作量浮动)。
5、客户须知: 3) 本公司对北京客户采取上门取样,异地客户需填写邮寄单
案例展示:
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